主庙位于马丘比丘城市区的神圣广场,是一座令人印象深刻的长方形建筑,由2面侧墙和1面后墙组成。寺庙底座由大石板构成,支撑更多规则尺寸和精确雕刻的宝石。主寺庙共有17个梯形形状的壁龛,最有可能用于仪式祭品。寺庙的后壁也有6个大石钉,可能用来悬挂装饰物或以某种方式在寺庙进行仪式。
在印加时代,据说这座寺庙装饰着最重要的印加领导人的五彩幔子,徽章和木乃伊。这座庙宇据说是一座平朔的肖像,这是一个神圣的象征印加神Wiraqocha的纯金制成的象征。当印加人在西班牙征服时废弃马丘比丘时,他们带走了所有最重要的文物,只留下我们今天看到的石头结构。
多年来的各种地震都破坏了主庙的结构造成损害。在建筑物的右后角最显着的是石头已经分离并向下移动。