Situato sulla Piazza Sacra nel Settore Urbano di Machu Picchu, il Tempio Principale è un imponente edificio di forma rettangolare composto da 2 pareti laterali e 1 parete posteriore. La base del tempio è costituita da grosse pietre litiche che sostengono pietre di dimensioni regolari e intagliate con precisione. Il Main Temple presenta un totale di 17 nicchie trapezoidali che sono state probabilmente utilizzate per le offerte cerimoniali. La parete posteriore del tempio ha anche 6 grandi pioli di pietra, che probabilmente erano usati per appendere decorazioni o per aiutare in qualche modo i rituali portati al tempio.
Durante il periodo Inca si diceva che il Tempio fosse adornato da mantelli colorati, emblemi e mummie dei più importanti leader Inca. Il tempio presumibilmente ospitava un'effige di P'unchao, un simbolo sacro divino fatto di oro massiccio che rappresenta il dio inca Wiraqocha. Quando gli Incas abbandonarono il Machu Picchu al tempo della conquista spagnola, portarono con sé tutti i manufatti più importanti lasciandosi dietro solo la struttura di pietra che vediamo oggi.
Vari terremoti nel corso degli anni hanno minato la struttura del Tempio principale causando danni. È più notevole nell'angolo posteriore destro dell'edificio, dove le pietre si sono separate e spostate verso il basso.